1、獬豸：这种神兽，体形大者如牛，小者如羊，类似麒麟，全身长着浓密黝黑的毛，双目明亮有神，额上通常长一角。獬豸拥有很高的智慧，懂人言知人性。它怒目圆睁，能辨是非曲直，能识善恶忠奸，发现奸邪的官员，就用角把他触倒，然后吃下肚子。它是勇猛、公正的象征。这种神兽一般不怎么出现，出现也是人间正义，勇猛的化身，人们对它大多比较尊敬，当然坏人们也很怕他。每当奸臣当道之时，人们就祈求它能出现。
2、当康：传说中的瑞兽，是一种兆丰穰的瑞兽，它是一个“其形如猪，身长六尺，高四尺，浑身青色，两只大耳，口中伸出四个长牙，如象牙一般，抱在外面’’，这个长相有点八戒的韵味。因为它的体型的原因，它也就被人们认为是很可爱的一种瑞兽，传说在丰收的年岁里当康会鸣叫着自己的名字跳着舞出现，象征着：丰收呜瑞，五谷丰登。
3、麒麟：中国传统瑞兽，性情温和，传说能活两千年。古人认为，麒麟出没处，必有祥瑞。有时用来比喻才能杰出、德才兼备的人。麒麟一直以来都是士子们的神兽，想自己能够遇到这种神兽，那样就可以飞黄腾达，高中榜首。
4、貔貅：貔貅有嘴无肛，能吞天下财而不漏，只进不出、神通特异，故有招财进宝、吸纳四方之财的寓意，同时也有赶走邪气、带来好运的作用。相传貔貅是三百多万年以前生活在西藏、四川康定一带的西域猛兽，具有极强的搏击能力。
5、乘黄：乘黄是一种神马，其身子像马，还长着龙的翅膀，背部长着两个角。传 说黄帝就是在乘坐乘黄之后才飞升成仙的。这种神兽恐怕谁都想遇到了吧。因为骑一下就能活两千岁。
6、龙：龙是中华民族文化的主要图腾，主要象征，有帝座的寓意。
龙是中国等东亚区域古代神话传说中的神异动物，为鳞虫之长。常用来象征祥瑞，是中华民族等东亚民族最具代表性的传统文化之一，龙的传说等龙文化非常丰富。
松田启人
配音：津村真琴（日）、陆惠玲（港）、王瑞芹（台）
搭档：基尔兽
简介：国小五年级学生，是家中的独生子。虽和前两代的主角都有一个护目镜，但并不喜欢踢足球，相反的，是个很喜欢画画的人，相对于前两季的主角，显得格外内向。家里经营着小型面包店。非常喜欢和朋友在新宿公园里玩数码宝贝卡片。上学前、放学后都会跟朋友玩卡片游戏，一直梦想着并创造了属于自己的数码宝贝——基尔兽。
D-Ark颜色是红色（变成红莲骑士兽后改为金色） 牧野留姬
配音：折笠富美子（日）、曾秀清（港）、谢佼娟（台）
搭档：妖狐兽
简介：一个不怎么笑又有点冷冷的少女，就读于私立女子小学五年级。在秋山辽失踪的那年的卡片大赛中获得冠军，被称为“数码暴龙皇后”。她很强，也很好强，在没有遇见启人和健良时，坚信战斗才是数码宝贝的宿命，但其实冷酷的外表下掩藏着一颗脆弱的心。自尊心很强的她，虽然看上去很冷漠，但实际上她很关心朋友。
D-Ark颜色为蓝色。 李健良
配音：山口真弓（日）、梁伟德（港）、于正升（台） 搭档：大耳兽简介：李建良是新宿中央小学五年级一班的学生，是启人隔壁班的同学。很喜欢玩电脑游戏。有一次在游戏中遇到了大耳兽，便结成了伙伴关系，虽然有一段辛苦的过去，可是他成了大耳兽的驯兽师，但他不喜欢让大耳兽和别的数码宝贝战斗。建良的爸爸是野生研究小组的成员。建良是家中兄弟姐妹中最大的一个，由于家里兄弟姐妹多，所以他学会了独立，坚强，很会照顾人。建良是个混血儿，爸爸是香港人，妈妈是日本人。与启人相处得很好，也曾经为他那不听话的妹妹李小春而头疼。
D-Ark颜色为绿色。 秋山辽
声优：金丸淳一（日）、陈卓智（港）、魏伯勤（台）
搭档：科学飞龙兽 简介：前年在Digimon大会上获得优胜的传说的驯兽师。大会之后便行踪不明，直到在数码世界和留姬他们相遇。带著搭档?科学飞龙兽在数码世界中旅行了10个月。小麦色的肌肤，闪亮的皓齿，爽朗的笑容，还有用留姬的话来说的话就是散发着「简直可以说毫无空隙的爽朗气」。言行之中充满著善意和友爱，连一丁点的阴云都没有。实力十分强劲，使用只有真正强大的驯兽师才能驾御的Device Card。脚本家小中千昭决定让他以“天才驯兽师”的形象客串进来。不同于游戏，作为动画人物，辽必须更有性格，且需要有一只数码兽搭档。强大的搭档、力量和英雄主义使得辽的个性更加鲜明。 加藤树莉
罗马音：Jyuri Katou
配音：浅田叶子（日）、刘姵颖（港）、詹雅菁（台）
搭档：狮子兽
简介：启人的同班同学之一。老家经营小饭馆 。拥有独特的感性。习惯借用狗布偶使用腹语术和周围的人沟通。口中说自己没有数码兽的卡片，实际上收集了一大堆，喜欢数码兽的心完全不输给博和跟建太。性格纤细中也包含着大胆。经常保持着无忧无虑充满朝气的笑容，其实内心非常敏感容易感伤有很多小心思。但绝对不会表现出来。后来成为了狮子兽的驯兽师。
D-Ark颜色为橙** 盐田博和
罗马音：Hiro
配音：玉木有纪子（日）雷碧娜（港）傅曼君（台）
搭档：守卫兽
简介：启人的同班同学，经常跟启人和健太进行数码宝贝卡片游戏。相当渴望能成为数码暴龙驯兽师，曾自己设计蓝卡变成真的蓝卡让基尔兽进化。
D-Ark颜色为咖啡色。 北川健太
罗马音：Kenta
配音：青山桐子（日）沈小兰（港）詹雅菁（台）
搭档：海天使兽
简介：启人的同班同学，经常跟启人和博和进行数码兽卡片游戏。在片中充当和事佬的角色，典型的学生形象。拍挡是海天使兽（究极体）。
D-Ark颜色为白色。 李小春
配音：永野爱（日）梁少霞（港）傅曼君（台）
搭档：黑大耳兽
简介：李健良的妹妹，性格倔强，稍有些任性，但是天真可爱。非常喜欢折腾大耳兽，常把它当布娃娃装扮，当布偶耍弄，大耳兽为此也没有办法。后期被呼唤到数码世界与十二帝魔中的安底罗兽相遇，并成为搭档。
D-Ark颜色是粉红色。 小爱
配音：寺田春日（日）郑丽丽（港）
简介：小妖兽的驯兽师之一，本名未出现，是驯兽师姐弟的姐姐，比弟弟稍微成熟一点，因为年纪幼小，曾为了小妖兽跟弟弟争吵，造成与小妖兽之间的误会，后期与小妖兽合好，为小妖兽加油的心意赋予‘堕天地狱兽·爆裂形态’能让他在天上自由飞行的－‘黑色羽翼’，最后与弟弟一起得到了小妖兽的D-Ark。
D-Ark颜色为紫色。 阿真
配音：松本美和（日）区瑞华（港）
简介：小妖兽的驯兽师之一，本名未出现。是驯兽师姐弟中的弟弟。因为年纪幼小，曾为了小妖兽跟姐姐争吵，造成与小妖兽之间的误会。后期与小妖兽合好，为小妖兽加油的心意赋予堕天地狱兽·爆裂形态，拥有强大力量的枪的武器－阳离子炮。最后与姐姐一起得到了小妖兽的D-Ark。
D-Ark颜色为紫色。